インデックスと引用グラフ
Index サーフェス
Synthesis Workbench → Index ページでは、Canonical Reference Index を管理できる。Index サーフェスには2 つのサブビューがある。
Registry ビュー
ライブラリ内の全追跡論文のリストを表示し、各行に論文とそのカバレッジ状態が表示される。
- 論文情報: タイトル、著者、年
- カバレッジ: Complete / Partial / Missing（3 つのアーティファクトタイプ — ダイジェスト、参考文献、引用分析 — のカバレッジ状態）
- 行の展開: 展開すると、論文の参考文献リストが表示され、各引用にバインディング状態（未バインド/候補/承認済み/却下済み）のマークが付く
- フィルタ: スコープ（すべて/ライブラリ/被引用）、カバレッジでフィルタリング、または検索
正規参考文献ビュー
アクティブなインデックスツールが "Revise Canonical" に切り替えられたときに表示される。
- 正規参考文献リスト: 重複排除された正規参考文献レコード
- 検索とフィルタ: バインディング状態、グラフ表示状態、リダイレクト状態、重複候補の有無でフィルタリング
- アクション: メタデータ編集、重複参考文献の統合、リダイレクト作成、レビューアイテムの表示
Canonical Reference Index
Canonical Reference Index は Synthesis システムのコアインデックスであり、ライブラリ内の論文からのすべての参考文献の重複排除と正規化を実行する。Reference Sidecar から生の引用データを取得し（概要の「Reference Sidecar」セクションを参照）、抽出、正規化、マッチバインディングを通じてインデックスを形成する。
機能
- 全文検索: すべての正規化された参考文献を横断検索
- メタデータ編集: 引用レコードのメタデータを修正
- 統合: 重複参考文献レコードを統合（自動的にリダイレクトを作成）
- リダイレクト: ある参考文献を別の正規レコードにポインタを設定
- レビュー: 引用マッチングの品質レビューアイテムを表示
- 重複排除: 潜在的な重複参考文献を発見
参考文献レコードタイプ
| タイプ | 説明 |
|---|---|
| Bound | Zotero ライブラリのアイテムに関連付け済み |
| External | 現在の Zotero ライブラリにない既知の文献 |
| Unresolved | 参考文献から抽出されたが、まだ識別されていない |
参考文献マッチングパイプライン
参考文献マッチングは、論文から抽出された参考文献と Zotero ライブラリ内のアイテムの間の関連付けを自動的に確立するプロセスである。システムは2 ステージモデルを使用して、パフォーマンスと精度のバランスを取る。
2 ステージモデル
ステージ 1：軽量 Sidecar リフレッシュ
通常操作時（例：ダイジェスト適用後）に実行され、Sidecar 状態をスキャンし、引用アーティファクトのハッシュを比較し、変更された参考文献のみを処理する。高度な重複排除やインデックス構築は実行せず、軽量な正規割り当てとバインディングのみを行う。
- トリガー: Workflow 実行完了後にアーティファクトが書き込まれた時点、または明示的なリフレッシュ操作
- スコープ: 差分（変更された参考文献のみ）
- アルゴリズム: 単純な識別子マッチング（DOI、arXiv、ISBN）
ステージ 2：高度な引用マッチング
明示的にトリガーされる深層マッチング操作。完全な引用マッチインデックスを構築し、包括的なマッチングと重複排除アルゴリズムを実行する。
- トリガー: ユーザーによる手動トリガー、定期メンテナンス
- スコープ: 全体
- アルゴリズム: 多戦略マッチング + クラスタリング重複排除
高度な引用マッチング、インデックスのリフレッシュ、引用グラフの再構築は計算集約的な操作である。Zotero は単一のホストプロセスアーキテクチャを使用しているため、これらの操作の実行中に UI の一時的な stuttering が発生する可能性がある。完了までお待ちください。この問題は将来のアーキテクチャリファクタリングで対応予定である。
マッチング戦略
| 戦略 | マッチ基準 | 信頼度 | 説明 |
|---|---|---|---|
| DOI マッチング | DOI 識別子 | 決定論的 | 完全一致、自動承認 |
| arXiv マッチング | arXiv ID | 決定論的 | 完全一致、自動承認 |
| ISBN マッチング | ISBN 番号 | 決定論的 | 完全一致、自動承認 |
| タイトル類似性 | ファジータイトルマッチング | 高/中/低 | 標準化されたタイトルとコンパクトタイトルを使用して類似度を計算 |
| 著者 + 年 | 著者名と出版年 | 中/低 | 著者正規化と年範囲を組み合わせてマッチング |
信頼度レベル
| レベル | 説明 | 推奨アクション |
|---|---|---|
deterministic | 決定論的マッチ | 自動承認 |
high | 高信頼度 | 承認可能 |
medium | 中信頼度 | レビュー推奨 |
low | 低信頼度 | レビュー必要 |
review | 人間の判断が必要 | レビュー必須 |
クラスタリング重複排除
高度なマッチングステージでは、正規参考文献に対してクラスタリング重複排除が実行される。アルゴリズムの流れは以下の通り。
- 各正規参考文献の重複排除レコードを構築（適格性フィルタリングと書誌情報ノイズ分析を含む）
- ペアワイズ比較でクラスターエッジを生成（識別子完全一致、タイトル正規マッチ、ファジータイトルマッチなど）
- エッジをクラスターとサブクラスターに集約
- 重複排除のための自動リダイレクトまたはレビュー提案を生成
安全制約：低信頼度のマッチ（例：contained_extension_risk）は自動リダイレクトをトリガーせず、ユーザーレビューが必要。
レビューサーフェス
レビューハブでは、引用マッチ提案を表示および処理し、個別に承認または却下できる。
引用グラフ
引用グラフは、ライブラリ内の論文とその参考文献をネットワークグラフとして可視化する。グラフデータは SQLite プロジェクションとして構築され、一定度のデータ遅延を許容する（リアルタイムミラーではない）。
ノードタイプ
| ノード | 色 | 説明 |
|---|---|---|
library_paper | 青 | Zotero ライブラリに既に存在する論文 |
external_reference | 緑 | ライブラリにない既知の参考文献 |
unresolved_reference | 灰 | 抽出されたが未識別の参考文献 |
エッジ情報
各引用エッジには以下の情報が含まれる。
- mention_count: 引用回数
- primary_role: 主な引用役割（例：background、comparison、support、contrast）
- aux_roles: 補助役割のリスト
- role_evidence: 役割判定の根拠
グラフメトリクス
引用グラフは各種メトリクスを計算でき、コア論文や影響力のある作品の特定に役立つ。
| メトリクス | 説明 |
|---|---|
| 引用数 | 論文が引用された総数 |
| PageRank | グラフ構造に基づくノード重要度スコア |
| Foundation Score | 分野の基盤的役割としての程度 |
| Frontier Score | 最先端の研究を表す程度 |
可視化レイアウト
| レイアウト | 説明 | ユースケース |
|---|---|---|
| Force（力指向） | d3-force レイアウト | 全体の構造を把握 |
| Radial（放射状） | 選択したノードを中心に展開 | 論文の引用ネットワークを分析 |
| Components（コンポーネント） | 連結成分でグループ化 | 独立した引用クラスターを発見 |
インタラクティブ操作
- ズーム/パン: グラフを自由に閲覧
- ホバー: ノードのラベルと基本情報を表示
- ノードクリック: Zotero で対応する論文アイテムを開く
- フィルタ: 役割、トピック、ノードタイプで表示される引用をフィルタリング
- 低シグナル引用の切替: 低引用数のエッジの表示/非表示
- 深度スライダー: 引用ネットワークの展開深度を制御
トピックフィルタリング
トピックで引用グラフをフィルタリングし、特定のトピックに関連する論文と引用関係のみを表示できる。トピックスコープはグラフ内で異なる色とグループで表示される。
次のステップ
- レビューハブ — 引用マッチと重複排除の提案をレビュー
- トピック統合の作成 — 引用ネットワークに基づくトピック分析を作成
- Home ダッシュボード — ライブラリインサイトメトリクスを確認
- WebDAV Sync — 引用バインディングデータをクロスデバイス同期