Synthesis Workbench 概要

Synthesis Workbench は、Zotero Agents が提供する文献深部分析プラットフォームである。ライブラリを構造化された知識ネットワークに変換し、トピック統合、引用分析、概念管理、統制語彙管理をサポートする。

Synthesis Workbench ホーム

開き方

ツールバーボタンまたはメニューから Dashboard / Synthesis Workspace を開く
Workspace Tab で Synthesis ビューに切り替える

全サーフェス（ページ）

Synthesis Workbench は 8 つのサーフェスで構成され、それぞれ異なる機能ビューを提供する。

サーフェス	機能	ドキュメント
Home	ライブラリ概要ダッシュボード：ライブラリインサイト（登録論文数/トピック数/グラフノード数）、Git 同期状態パネル、トレンドトピックカードリスト	詳細
Topics	トピックリストと管理：3 つのビューモード（グラフ/グリッド/リスト）、トピックの作成と更新、トピック検索と並び替え	詳細
Index	正規参考文献インデックス：論文レジストリビュー（論文リスト + 引用行 + バインディング状態）、正規参考文献ビュー（検索/統合/リダイレクト/重複排除）	詳細
Review	レビューハブ：3 つのサブタブ — 引用マッチレビュー（バインディング提案の承認/却下）、概念レビュー、トピックグラフ関係レビュー	詳細
Graph	引用グラフの可視化（力指向/放射状/コンポーネント — 3 つのレイアウト）、トピックフィルタリングとノード/エッジ操作	詳細
Tags	統制タグ語彙管理 + 自動タグ提案の承認	詳細
Concepts	概念知識ベース管理：概念/意味/別名/関係の 4 層構造、トピックグラフやリーダーにオーバーレイ可能	詳細
Reader	トピックリーダー：8 つのサブページ（Overview、Taxonomy、Claims、Compare、Future Directions、Coverage、References、Report）を持つ完全なトピック詳細ページ	詳細

コアコンセプト

Canonical Store

Canonical Store は、Synthesis システムの知識グラフ基盤ストレージである。Zotero データディレクトリにコンテンツアドレス指定可能な JSON ファイルを保存する。

保存場所： <Zotero データディレクトリ>/zotero-agents/data/synthesis/

ディレクトリ構造：

synthesis/
├── topics/             # トピック統合の構造化アーティファクト
├── concepts/           # 概念知識ベース
├── topic-graph/        # トピックグラフのノードとエッジ
├── citation-graph/     # 引用グラフのスナップショット
├── tags/               # 統制タグ語彙
├── sync/               # Git 同期ワーキングツリー
└── state/              # ランタイム状態（トランザクション、レシート、キャッシュなど）

各ファイルは CanonicalEnvelope という JSON エンベロープ形式を使用し、スキーマ ID、バージョン番号、タイムスタンプ、スキーマ検証済みデータ本体を含む。書き込み操作はトランザクションセマンティクスを使用する。データはまずトランザクションディレクトリにステージされ、検証成功後に正規位置に昇格し、失敗時は自動的にロールバックされる。

Reference Sidecar

Reference Sidecar は、各論文に添付されたアーティファクトのインデックスである。Workflow が文献アイテムを処理してダイジェスト、参考文献リスト、引用分析を生成すると、これらのアーティファクトは構造化ノート（Zotero Notes）としてアイテムに添付される。Sidecar システムはこれらのノートをスキャンし、アーティファクトの状態（完全/一部/欠落）をインデックスに記録する。

Sidecar スキャンサイクル： Sidecar は以下のタイミングでスキャンがトリガーされる。

Workflow 実行完了後、アーティファクトが書き込まれた時点
明示的な Sidecar 更新操作がトリガーされた時点
システム起動時に古い Sidecar データを検出した時点

アーティファクト種別：

アーティファクト	説明
`digest`	論文ダイジェスト（Markdown）
`references`	参考文献リスト（JSON）
`citation_analysis`	引用分析レポート（JSON）

Sidecar データは Canonical Reference Index の主要な入力源となる。システムは references アーティファクトから引用レコードを抽出し、正規参考文献を確立した後、ライブラリアイテムとのマッチングとバインディングを試みる。

データフロー

Zotero Library
    │
    ├──→ Workflow 実行（Literature Analysis / Deep Reading）
    │         │
    │         ↓
    │   アーティファクトノート（ダイジェスト/参考文献/引用分析）
    │         │
    │         ↓
    │   Reference Sidecar ← アーティファクト状態をスキャン
    │         │
    │         ├──→ Canonical Reference Index
    │         │         │
    │         │         ├──→ 引用バインディング（Zotero アイテムにバインド）
    │         │         └──→ 引用グラフ
    │         │
    │         └──→ トピック統合
    │                   │
    │                   ├──→ トピックグラフ（トピック間関係）
    │                   └──→ 概念関連付け（Concept KB）
    │
    └──→ Git Sync ←→ リモートリポジトリ（バージョン管理とバックアップ）

前提条件

Synthesis Workbench を使用するには以下が必要である。

設定済みの Skill-Runner バックエンド（統合 Workflow の実行用）
ライブラリに論文アイテムが既に存在していること

次のステップ

Home ダッシュボード — ライブラリ概要と同期状態を確認
タグ管理 — 統制タグ語彙を管理
インデックスと引用グラフ — 参考文献インデックスと引用ネットワークについて学ぶ
トピック統合の作成 — トピック分析を作成
レビューハブ — 引用マッチ、概念、トピックグラフの提案をレビュー
概念知識ベース — コア概念を管理
Git Sync — データの同期とバックアップを設定

開き方​

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コアコンセプト​

Canonical Store​

Reference Sidecar​

データフロー​

前提条件​

次のステップ​

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