Synthesis Workbench 概览

Synthesis Workbench（综合工作台）是 Zotero Agents 提供的深度文献分析平台。它将您的文献库转化为结构化的知识网络，支持主题综合、引文分析、概念管理和受控词表管理。

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所有 Surface（页面）

Synthesis Workbench 包含 8 个 Surface，每个提供不同的功能视图：

Surface	功能	文档
Home	文献库概览仪表板：库洞察（已注册论文/主题数/图节点）、Git 同步状态面板、热门主题卡片列表	详情
Topics	主题列表和管理：3 种视图模式（图/网格/列表）、创建和更新主题、主题检索和排序	详情
Index	Canonical Reference 索引：论文注册表视图（论文列表 + 引用行 + 绑定状态）、规范参考视图（搜索/合并/重定向/去重）	详情
Review	审核中心：3 个子标签页——引用匹配审核（接受/拒绝绑定提案）、概念审核、主题图关系审核	详情
Graph	引文图谱可视化（力导向/径向/组件 3 种布局），支持按主题过滤、节点/边交互	详情
Tags	受控标签词表管理 + 自动打标建议审批	详情
Concepts	概念知识库管理：概念/义项/别名/关系四层结构，可叠加到主题图和阅读器	详情
Reader	主题阅读器：完整的 Topic Detail 页面，含 8 个子页面（Overview、Taxonomy、Claims、Compare、Future Directions、Coverage、References、Report）	详情

核心概念

Canonical Store（规范存储）

Canonical Store 是 Synthesis 系统的底层知识图谱存储。它以内容可寻址的 JSON 文件形式，存储在 Zotero 数据目录中。

存储位置： <Zotero 数据目录>/zotero-agents/data/synthesis/

目录结构：

synthesis/
├── topics/             # 主题综合的结构化产物
├── concepts/           # 概念知识库
├── topic-graph/        # 主题图谱节点和边
├── citation-graph/     # 引文图谱快照
├── tags/               # 受控标签词表
├── sync/               # Git 同步工作树
└── state/              # 运行时状态（事务、收据、缓存等）

每个文件使用 JSON 包裹格式（CanonicalEnvelope），包含 schema ID、版本号、时间戳和经过模式验证的数据体。写入操作使用事务语义：先暂存到事务目录，验证通过后再提升到正式位置，失败时自动回滚。

Reference Sidecar（参考文献侧车）

Reference Sidecar 是每篇论文附属产物的索引。当 workflow 处理一篇文献并生成摘要、参考文献列表和引文分析后，这些产物以结构化注释（Zotero Note）的形式挂载在论文条目下。Sidecar 系统会扫描这些 notes，将产物状态（完整/部分/缺失）记录到索引中。

Sidecar 扫描周期： Sidecar 在以下时机被触发扫描：

Workflow 执行完成并写入产物后
显式触发 Sidecar 刷新操作
系统启动时检测到 Sidecar 过期

产物类型：

产物	说明
`digest`	文献摘要（Markdown）
`references`	参考文献列表（JSON）
`citation_analysis`	引文分析报告（JSON）

Sidecar 数据是 Canonical Reference Index 的基础输入——系统从 references 产物中提取引用记录，建立规范引用，再尝试与库内条目匹配绑定。

数据流

Zotero 文献库
    │
    ├──→ Workflow 执行（文献分析/深度阅读）
    │         │
    │         ↓
    │   产物 Notes（摘要/参考文献/引文分析）
    │         │
    │         ↓
    │   Reference Sidecar ← 扫描产物状态
    │         │
    │         ├──→ 规范引用索引（Canonical Reference Index）
    │         │         │
    │         │         ├──→ 引用绑定（绑定到 Zotero 条目）
    │         │         └──→ 引文图谱（Citation Graph）
    │         │
    │         └──→ 主题综合（Topic Synthesis）
    │                   │
    │                   ├──→ Topic Graph（主题关系）
    │                   └──→ 概念关联（Concept KB）
    │
    └──→ Git 同步 ←→ 远程仓库（版本管理和备份）

前提条件

使用 Synthesis Workbench 需要：

已配置 Skill-Runner 后端（用于执行合成 workflow）
文献库中已有论文条目

下一步

Home 仪表板 — 查看库概览和同步状态
Tags 管理 — 管理受控标签词表
索引与引文图谱 — 了解引用索引和引文网络
创建 Topic 综合 — 创建主题分析
审核中心 — 审核引用匹配、概念和主题图提案
概念知识库 — 管理核心概念
Git 同步 — 配置数据同步和备份

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